Suche
Mein Konto
Dereglarea proteinelor de legare a ARN-ului în artrita reumatoidă și osteoartrita
Se anunță o nouă publicație pentru revista Acta Materia Medica. Datele de secvențiere a ARN-ului cu o singură celulă (SCRNA-Seq) din seturile de date publicate au fost obținute pentru a examina expresia și dereglarea proteinelor de legare a ARN (RBPS), care sunt esențiale pentru splicingul ARNm alternativ și controlul translațional în artrita reumatoidă (RA). Modul în care reglarea RBP diferă între RA și osteoartrita (OA) a fost examinat folosind RBP pentru subclustering celular. Au fost efectuate reacții cantitative în lanț a polimerazei (PCR) pentru a confirma RBP exprimate diferențial în sinoviocitele fibroblastice RA (FLSS) și OA-FLS, precum și la șoarecii cu artrită indusă de colagen (CIA) și șoarecii de control. În plus, au fost colectate datele ARN-seq în vrac și au fost efectuate analize de coexpresie ale evenimentelor alternative de îmbinare (ASE) RBP pentru a...
Dereglarea proteinelor de legare a ARN-ului în artrita reumatoidă și osteoartrita
Se anunță o nouă lansare pentruActa Materia MedicaRevistă. Datele de secvențiere a ARN-ului cu o singură celulă (SCRNA-Seq) din seturile de date publicate au fost obținute pentru a examina expresia și dereglarea proteinelor de legare a ARN (RBPS), care sunt esențiale pentru splicingul ARNm alternativ și controlul translațional în artrita reumatoidă (RA). Modul în care reglarea RBP diferă între RA și osteoartrita (OA) a fost examinat folosind RBP pentru subclustering celular.
Au fost efectuate reacții cantitative în lanț a polimerazei (PCR) pentru a confirma RBP exprimate diferențial în sinoviocitele fibroblastice RA (FLSS) și OA-FLS, precum și la șoarecii cu artrită indusă de colagen (CIA) și șoarecii de control. În plus, au fost colectate datele ARN-seq în vrac și au fost efectuate analize de co-expresie ale evenimentelor alternative de splicing RBP (ASE) pentru a dezvălui rolul potențial de reglementare al RBP-urilor legate de RA cu ASD. S-au demonstrat variații semnificative în proporțiile relative ale subtipurilor de celule între RA și OA, cu RBP reglați în jos, RBP suprareglați în fiecare tip de celule și care prezintă o specificitate ridicată pentru anumite subseturi. O sută cinci RBP reglate în sus și 133 de RBP reglate în jos au fost identificate în fibroblaste. S-a constatat că proteina 3 de legare a casetei Y (YBX3) și subunitatea 6 a factorului de îmbinare 3B (SF3B6) sunt reglate în sus la șoarecii RA-FLS și CIA) au fost reglate în jos în RA-FLS. Grupul RA a arătat interacțiuni mai puternice cu tipurile de celule în comparație cu grupul OA cu căi de semnalizare îmbunătățite, cum ar fi: B. Fibronectin 1 cluster de diferențiere 44 (FN1-CD44) și CXC motiv chemokine ligand 12-CXC motiv chemokine receptor 4 (CXCL12-CXCR4).
În plus, trei gene suprareglate (repetarea spectrinei care conține proteina 2 a anvelopei nucleare, care conține proteina 2 [SYNE2]S100 proteina de legare de calciu A9 [S100A9] și proteina indusă de interferon care conține tetratricopeptidă repetă 3 [IFIT3]) și patru gene reglate în jos (ribonucleaza 1 [RNA1SE2] și granulin [RNA1SE3]N] care conține 2 [SORBS2]) au fost co-exprimate în RBP și ASES asociate cu RA.
Aceste rezultate sugerează că dereglarea RBP poate contribui la dezvoltarea RA și poate oferi ținte potențiale pentru intervenții terapeutice.
Surse:
Luo, H.,et al. (2025). Descifrarea programelor de reglementare ale proteinelor de legare a ARN în artrita reumatoidă prin analiza transcriptomului unicelular. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.