Suche
Mein Konto
Disregulacija proteinov, ki vežejo RNA, pri revmatoidnem artritisu in osteoartritisu
Napovedujemo novo publikacijo revije Acta Materia Medica. Podatki enoceličnega sekvenciranja RNA (SCRNA-Seq) iz objavljenih naborov podatkov so bili pridobljeni za preučevanje izražanja in disregulacije proteinov, ki vežejo RNA (RBPS), ki so kritični za alternativno spajanje mRNA in translacijski nadzor pri revmatoidnem artritisu (RA). Kako se regulacija RBP razlikuje med RA in osteoartritisom (OA), je bilo raziskano z uporabo RBP za celično subgručenje. Izvedene so bile kvantitativne verižne reakcije s polimerazo (PCR) za potrditev različno izraženih RBP v fibroblastičnih sinoviocitih RA (FLSS) in OA-FLS ter pri miših s kolagenom induciranim artritisom (CIA) in kontrolnih miših. Poleg tega so bili zbrani množični podatki RNA-seq in izvedene so bile analize koekspresije RBP alternativnih dogodkov spajanja (ASE), da ...
Disregulacija proteinov, ki vežejo RNA, pri revmatoidnem artritisu in osteoartritisu
Napovedujemo novo izdajo zaActa Materia MedicaRevija. Podatki enoceličnega sekvenciranja RNA (SCRNA-Seq) iz objavljenih naborov podatkov so bili pridobljeni za preučevanje izražanja in disregulacije proteinov, ki vežejo RNA (RBPS), ki so kritični za alternativno spajanje mRNA in translacijski nadzor pri revmatoidnem artritisu (RA). Kako se regulacija RBP razlikuje med RA in osteoartritisom (OA), je bilo raziskano z uporabo RBP za celično subgručenje.
Izvedene so bile kvantitativne verižne reakcije s polimerazo (PCR) za potrditev različno izraženih RBP v fibroblastičnih sinoviocitih RA (FLSS) in OA-FLS ter pri miših s kolagenom induciranim artritisom (CIA) in kontrolnih miših. Poleg tega so bili zbrani množični podatki RNA-seq in izvedene so bile analize koekspresije RBP alternativnih dogodkov spajanja (ASE), da bi razkrili potencialno regulativno vlogo z RA povezanih RBP z ASD. Znatne razlike v relativnih deležih podtipov celic so bile dokazane med RA in OA z znižanimi RBP, prekomerno reguliranimi RBP v vsaki vrsti celice in kažejo visoko specifičnost za nekatere podskupine. V fibroblastih je bilo identificiranih 150 navzgor reguliranih in 133 znižanih RBP. Ugotovljeno je bilo, da sta vezavni protein Y-box 3 (YBX3) in podenota 6 faktorja spajanja 3B (SF3B6) regulirana navzgor pri miših RA-FLS in CIA) znižana v RA-FLS. Skupina RA je pokazala močnejše interakcije s tipi celic v primerjavi s skupino OA z izboljšanimi signalnimi potmi, kot so: B. Fibronektin 1 grozd diferenciacije 44 (FN1-CD44) in CXC motiv kemokinski ligand 12-CXC motiv kemokinski receptor 4 (CXCL12-CXCR4).
Poleg tega so trije regulirani geni (spektrinska ponovitev, ki vsebuje protein jedrske ovojnice 2, ki vsebuje protein 2 [SYNE2]S100 protein, ki veže kalcij, A9 [S100A9] in z interferonom induciran protein, ki vsebuje tetratrikopeptidne ponovitve 3 [IFIT3]) in štirje znižano regulirani geni (ribonukleaza 1 [RNASE1]granulin [GRN]Fn1 in sorbinom in domeno SH3, ki vsebuje 2 [SORBS2]), so bile sočasno izražene v RBP, povezanih z RA, in ASES.
Ti rezultati kažejo, da lahko disregulacija RBP prispeva k razvoju RA in zagotovi potencialne tarče za terapevtske posege.
Viri:
Luo, H.,et al. (2025). Dešifriranje regulativnih programov proteinov, ki vežejo RNK, pri revmatoidnem artritisu z analizo enoceličnega transkriptoma. Acta Materia Medica. doi.org/10.15212/amm-2024-0034.