类风湿性关节炎和骨关节炎中 RNA 结合蛋白的失调

类风湿性关节炎和骨关节炎中 RNA 结合蛋白的失调

宣布新版本药物学报杂志。从已发表的数据集中获得单细胞 RNA 测序 (SCRNA-Seq) 数据，以检查 RNA 结合蛋白 (RBPS) 的表达和失调，这对于类风湿性关节炎 (RA) 的选择性 mRNA 剪接和翻译控制至关重要。使用 RBP 进行细胞亚聚类检查了 RA 和骨关节炎 (OA) 之间 RBP 调节的差异。

进行定量聚合酶链反应（PCR）以确认 RA 成纤维滑膜细胞（FLSS）和 OA-FLS 以及胶原诱导关节炎（CIA）小鼠和对照小鼠中差异表达的 RBP。此外，收集了大量 RNA-seq 数据，并进行 RBP 选择性剪接事件 (ASE) 共表达分析，以揭示 RA 相关 RBP 对 ASD 的潜在调节作用。 RA 和 OA 之间的细胞亚型相对比例存在显着差异，每种细胞类型中 RBP 下调，RBP 过度调节，并且对某些亚型表现出高度特异性。在成纤维细胞中鉴定出 105 个上调的 RBP 和 133 个下调的 RBP。发现 Y 盒结合蛋白 3 (YBX3) 和剪接因子 3B 亚基 6 (SF3B6) 在 RA-FLS 中上调，而 CIA 小鼠在 RA-FLS 中下调。与 OA 组相比，RA 组与细胞类型的相互作用更强，信号通路得到改善，例如：B. 纤连蛋白 1 分化簇 44 (FN1-CD44) 和 CXC 基序趋化因子配体 12-CXC 基序趋化因子受体 4 (CXCL12-CXCR4)。

此外，还发现了三个上调基因（包含核膜蛋白 2 的血影蛋白重复序列、包含蛋白 2 [SYNE2]S100 钙结合蛋白 A9 [S100A9] 和包含四三肽重复序列 3 [IFIT3] 的干扰素诱导蛋白）和四个下调基因（核糖核酸酶 1 [RNASE1] 颗粒蛋白 [GRN]Fn1 以及包含 2 [SORBS2] 的山梨蛋白和 SH3 结构域）。在 RA 相关 RBP 和 ASES 中共表达。
这些结果表明 RBP 失调可能促进 RA 的发展，并为治疗干预提供潜在目标。

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