Вирусът Oropouche става глобален: Проучването съдържа нови рискове от реформите на вируса

Вирусът Oropouche става глобален: Проучването съдържа нови рискове от реформите на вируса

Ново проучване показва как вирусът Oropouche избухна от Амазонка и се разпространи в Бразилия и извън нея. Учените предупреждават, че промяната в околната среда, човешката мобилност и еволюцията на вирусите стимулират бързото му разрастване – и налагат глобалните опасения за общественото здраве.

Вирусът Oropouche (OOV), исторически ограничен до бразилския басейн на Амазонка, е причинил множество огнища в много бразилски щати от 2022 г. насам. Наскоро много случаи на Orov бяха открити извън Бразилия.

Изследователите са извършили секвениране на целия геном на вирусни изолати от региони на огнища, за да разберат динамиката на предаването на вируса към неендемични региони. Проучването е публикувано вJournal of Travel Medicine.

фон

Вирусът вероятно е циркулирал незабелязано в Амазонка повече от десетилетие, като геномните следи показват тихо разпространение още през 2010-2014 г. поради непоследователно наблюдение.

Oropouche virus (OOV) е пренасян от членестоноги, едноверижен РНК вирус, който е сегментиран на три части: малка, средна и голяма. Тези три сегмента кодират основни компоненти, необходими за растежа, предаването и инфекциозността на вируса.

следОткрит за първи път в Тринидад и Тобаго през 1955 г., вирусът е причинил няколко огнища сред животни (нечовекоподобни примати, ленивци и птици) в басейна на Амазонка. При хората вирусът се предава предимно от комари (комари (Culicoides paraenesis) и причинява леки до умерени инфекции, които преминават в рамките на една седмица.

Към август 2024 г. са докладвани приблизително 30 огнища в Латинска Америка. Въпреки това, последните епидемиологични данни показват рязко увеличение на случаите на OROV в няколко неендемични бразилски щата, като случаите са докладвани в Италия, Испания и Германия от пътници, посещаващи Куба.

Първите три фатални случая на инфекции с OVOV също бяха докладвани в Бразилия през 2024 г. Всички тези доклади подчертават разпространението на вируса извън Амазонка и предизвикват безпокойство сред служителите в общественото здравеопазване.

Дизайн на проучването

Изследователите извършиха секвениране на целия геном на проби, получени от пациенти, заразени с Orov, събрани от пет бразилски щата между февруари и май 2024 г. Те избраха пробите за геномен анализ въз основа на наличните клинични и епидемиологични метаданни.

Те генерират 133 последователности от цял ​​геном, покриващи трите геномни сегмента на вируса: малкия, средния и големия сегмент. Тези последователности включват първите геноми от региони извън Амазонка и от първите регистрирани случаи.

Резултати от изследването

Изследователите свързват отглеждането на банани и какао с праговете за популация на мушици, създавайки вирусни горещи точки, където обезлесяването съответства на селското стопанство.

Проучването съобщава за рязко увеличение на инфекциите с OROV при хора в западния регион на Амазонка между края на 2022 г. и началото на 2024 г. Тази индукция съвпадна с увеличаване на честотата на тестване на OROV (от 238 теста през 2020 г. на 54 428 в началото на 2024 г.) в цялата страна, което показва засилени усилия за наблюдение.

Филогенетичният анализ разкрива, че новите вирусни последователности, генерирани в проучването, споделят общ предшественик с последователности, получени от басейна на Амазонка от 2022 г. насам, което предполага възможен амазонски произход на най-новата вирусна линия.

Поради своя сегментиран модел, геномът на OROV вероятно ще претърпи събития на повторно отпечатване и рекомбинация. Проучването идентифицира 21 реформи (включително 17 SM, 7 SL и 11 ML реформи). Дали тези геномни промени улесняват адаптирането на вируса към местни екологични заболявания или допринасят за тяхната инфекциозност и патогенност остава неясно.

Чрез извършване на филогеографска реконструкция на бразилския набор от данни за 2022-2024 г. заедно с наскоро изолирани международни геномни последователности от Перу и Италия, проучването установи бързо предаване на вируса от север на юг в Бразилия, последвано от трансгранично предаване в Перу.

Проучването установи също, че случаите на Orov, докладвани в Италия, са свързани с пътници, завърнали се от Куба. Кубинските случаи обаче се извеждат единствено от историята на пътуванията, тъй като геномните данни от самата Куба не са налични, което ограничава окончателните заключения относно пътищата на предаване. Тези наблюдения подчертават ролята на човешката мобилност в разпространението на вируса.

Проучете значението

Докато повечето инфекции отзвучават в рамките на една седмица, първата документирана смърт, свързана с OROV, предизвиква тревога относно рисковете по време на бременност.

Проучването показва как еволюцията на OROV чрез геномни реформи е улеснила бързото му предаване в и извън Бразилия. Резултатите показват, че между 2010 г. и 2014 г. линията 2022–2024 г. се е появила в централната част на Амазония, с доказателства за дългосрочен загадъчен цикъл в Амазонка в края на 2010 г., базиран на ограничен мониторинг.

Движението на вируса от север на юг съвпада с дъждовния сезон в басейна на Амазонка. Съществуващите еко-епидемиологични проучвания показват, че Orov предпочитано циркулира в региони с висока гъстота на населението, благоприятни климатични условия и намалена вечнозелена широка горска покривка.

Освен това обезлесяването, урбанизацията и селскостопанските практики (напр. отглеждане на банани и какао) улесняват размножаването на мушици, като по този начин увеличават риска от предаване на вируса и оформят географския обхват на вируса.
Откриването на първите три фатални случая на Orov при млади възрастни без съпътстващи заболявания – включително мутации в сегментите M (I13V, M642I) и L (T857A) – подчертава необходимостта от по-нататъшно изследване със специален фокус върху вертикалното предаване и резултатите от бременността.

Бразилското министерство на здравеопазването наскоро съобщи за първата смърт на плода, дължаща се на Orov с предаване от майка на дете в Пернамбуко. Въпреки това, асимптоматични или леки случаи може да са недостатъчно представени в наборите от геномни данни, което отклонява усилията за наблюдение. Това подчертава необходимостта от идентифициране на вирусни фактори, свързани с тежки резултати, и разработване на ефективни интервенции.

Проучването идентифицира случаи, свързани с ORROV, свързани с пътуване, което предполага, че човешката мобилност играе важна роля в разпространението на вируса в Бразилия. Основните ограничения включват липсата на геномни данни от Колумбия, Куба и други засегнати страни, което възпрепятства пълното разбиране на мрежите за предаване.

Като цяло, проучването подчертава спешността от непрекъснато геномно наблюдение, за да се разбере еволюционната и епидемиологичната динамика на OOV. Това е особено важно за предотвратяване на бъдещи огнища и осигуряване на навременни реакции на общественото здраве.

източници: