Virus Oropouche je globální: Studie obsahuje nová rizika virových reforem

Virus Oropouche je globální: Studie obsahuje nová rizika virových reforem

Nová studie ukazuje, jak virus Oropouche pronikl z Amazonie a rozšířil se do Brazílie a dále. Vědci varují, že změny životního prostředí, lidská mobilita a virová evoluce jsou hnací silou jeho rychlého rozmachu – a naléhavých obav globálního veřejného zdraví.

Virus Oropouche (OOV), historicky omezený na brazilské povodí Amazonky, způsobil od roku 2022 několik ohnisek v mnoha brazilských státech. Nedávno bylo mnoho případů Orov objeveno mimo Brazílii.

Vědci provedli celogenomové sekvenování virových izolátů z oblastí ohniska, aby pochopili dynamiku přenosu viru do neendemických oblastí. Studie je zveřejněna vJournal of Travel Medicine.

pozadí

Virus pravděpodobně cirkuloval nedetekován v Amazonii více než deset let, přičemž genomové stopy naznačovaly tiché šíření již v letech 2010-2014 kvůli nedůslednému sledování.

Oropouche virus (OOV) je jednovláknový RNA virus přenášený členovci, který je rozdělen do tří částí: malá, střední a velká. Tyto tři segmenty kódují základní složky potřebné pro růst viru, přenos a infekčnost.

PoVirus byl poprvé zjištěn v Trinidadu a Tobagu v roce 1955 a způsobil několik propuknutí u zvířat (nečlověčích primátů, lenochodů a ptáků) v povodí Amazonky. U lidí je virus přenášen především komáry (komářiCulicoides paraenesis) a způsobuje mírné až středně závažné infekce, které vymizí do týdne.

K srpnu 2024 bylo v Latinské Americe hlášeno přibližně 30 ohnisek. Nedávné epidemiologické údaje však ukazují prudký nárůst případů OROV v několika neendemických brazilských státech, přičemž případy byly hlášeny v Itálii, Španělsku a Německu od cestovatelů, kteří navštívili Kubu.

První tři smrtelné případy infekcí OVOV byly také hlášeny v Brazílii v roce 2024. Všechny tyto zprávy podtrhují šíření viru mimo Amazonii a vyvolávají obavy mezi úředníky veřejného zdraví.

Návrh studie

Výzkumníci provedli celogenomové sekvenování vzorků pocházejících od pacientů infikovaných Orovem odebraných z pěti brazilských států mezi únorem a květnem 2024. Vybrali vzorky pro genomickou analýzu na základě dostupných klinických a epidemiologických metadat.

Vytvořili 133 celogenomových sekvencí pokrývajících tři genomové segmenty viru: malý, střední a velký segment. Tyto sekvence zahrnovaly první genomy z oblastí mimo Amazonii a z prvních zaznamenaných případů.

Výsledky studie

Výzkumníci spojili pěstování banánů a kakaa s populačními prahy pakomárů a vytvořili virová ohniska, kde odlesňování odpovídá zemědělství.

Studie oznámila prudký nárůst lidských infekcí OROV v západní oblasti Amazonie mezi koncem roku 2022 a začátkem roku 2024. Tato indukce se shodovala se zvýšením frekvence testování OROV (z 238 testů v roce 2020 na 54 428 na začátku roku 2024) v celé zemi, což ukazuje na intenzivnější sledování.

Fylogenetická analýza odhalila, že nové virové sekvence vytvořené ve studii sdílejí společného předka se sekvencemi získanými z povodí Amazonky od roku 2022, což naznačuje možný amazonský původ nejnovější virové linie.

Vzhledem ke svému segmentovanému vzoru je pravděpodobné, že genom OROV podstoupí přetisk a rekombinaci. Studie identifikovala 21 reformních událostí (včetně 17 SM, 7 SL a 11 ML reforem). Zda tyto genomové změny usnadnily adaptaci viru na místní ekologické choroby nebo přispěly k jejich infekčnosti a patogenitě, zůstalo nejasné.

Provedením fylogeografické rekonstrukce brazilského souboru dat 2022-2024 spolu s nedávno izolovanými mezinárodními genomovými sekvencemi z Peru a Itálie studie zjistila rychlý virový přenos ze severu na jih v Brazílii, po kterém následoval přeshraniční přenos v Peru.

Studie také zjistila, že případy Orova hlášené v Itálii jsou spojeny s cestujícími, kteří se vrátili z Kuby. Kubánské případy jsou však odvozeny pouze z cestovní historie, protože genomická data z Kuby samotné nejsou k dispozici, což omezuje konečné závěry o přenosových cestách. Tato pozorování zdůrazňují roli lidské mobility při šíření viru.

Prozkoumejte význam

Zatímco většina infekcí vymizí do týdne, první zdokumentovaná smrt související s OROV vyvolává poplach ohledně rizik během těhotenství.

Studie ukazuje, jak evoluce OROV prostřednictvím genomických reforem usnadnila její rychlý přenos v Brazílii i mimo ni. Výsledky ukazují, že v letech 2010 až 2014 se v centrální Amazonii objevila linie 2022–2024 s důkazy o dlouhodobém kryptickém cyklu v Amazonii na konci roku 2010 na základě omezeného sledování.

Pohyb viru ze severu na jih studie se shoduje s obdobím dešťů v povodí Amazonky. Stávající ekoepidemiologické studie naznačují, že Orov přednostně cirkuluje v regionech s vysokou hustotou osídlení, příznivými klimatickými podmínkami a sníženým stálezeleným širokým lesním porostem.

Kromě toho odlesňování, urbanizace a zemědělské postupy (např. pěstování banánů a kakaa) usnadňují šlechtění pakomárů, čímž se zvyšuje riziko přenosu viru a utváří geografický rozsah viru.
Detekce prvních tří fatálních případů Orova u mladých dospělých bez komorbidit – včetně mutací v segmentech M (I13V, M642I) a L (T857A) – zdůrazňuje potřebu dalšího vyšetřování se zvláštním zaměřením na vertikální přenos a výsledky těhotenství.

Brazilské ministerstvo zdravotnictví nedávno oznámilo první úmrtí plodu způsobené Orovem s přenosem z matky na dítě v Pernambucu. Asymptomatické nebo mírné případy však mohou být v souborech genomických dat nedostatečně zastoupeny, což zkresluje snahy o sledování. To zdůrazňuje potřebu identifikovat virové faktory spojené s vážnými následky a vyvinout účinné intervence.

Studie identifikovala případy související s ORROV spojené s cestováním, což naznačuje, že lidská mobilita hraje důležitou roli v šíření viru po Brazílii. Mezi klíčová omezení patří nedostatek genomických dat z Kolumbie, Kuby a dalších postižených zemí, což brání úplnému pochopení přenosových sítí.

Celkově studie zdůrazňuje naléhavost nepřetržitého sledování genomu pro pochopení evoluční a epidemiologické dynamiky OOV. To je zvláště důležité pro prevenci budoucích ohnisek a pro zajištění včasné reakce veřejného zdraví.

Zdroje: