Ο ιός Oropouche γίνεται παγκόσμιος: Η μελέτη περιέχει νέους κινδύνους από τις μεταρρυθμίσεις του ιού

Ο ιός Oropouche γίνεται παγκόσμιος: Η μελέτη περιέχει νέους κινδύνους από τις μεταρρυθμίσεις του ιού

Μια νέα μελέτη δείχνει πώς ο ιός Oropouche ξέσπασε από τον Αμαζόνιο και εξαπλώθηκε στη Βραζιλία και όχι μόνο. Οι επιστήμονες προειδοποιούν ότι η περιβαλλοντική αλλαγή, η ανθρώπινη κινητικότητα και η εξέλιξη του ιού οδηγούν την ταχεία επέκτασή του – και πιέζουν τις παγκόσμιες ανησυχίες για τη δημόσια υγεία.

Ο ιός Oropouche (OOV), ιστορικά περιορισμένος στη λεκάνη του Αμαζονίου της Βραζιλίας, έχει προκαλέσει πολλαπλά κρούσματα σε πολλές πολιτείες της Βραζιλίας από το 2022. Πρόσφατα, πολλά κρούσματα Orov έχουν ανακαλυφθεί πέρα ​​από τη Βραζιλία.

Οι ερευνητές διεξήγαγαν αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος απομονωθέντων ιών από περιοχές εστίας για να κατανοήσουν τη δυναμική της μετάδοσης του ιού σε μη ενδημικές περιοχές. Η μελέτη δημοσιεύεται στοJournal of Travel Medicine.

φόντο

Ο ιός πιθανότατα κυκλοφορούσε απαρατήρητος στον Αμαζόνιο για πάνω από μια δεκαετία, με γονιδιωματικά ίχνη να υποδεικνύουν μια σιωπηλή εξάπλωση ήδη από το 2010-2014 λόγω ασυνεπούς επιτήρησης.

Ο ιός Oropouche (OOV) είναι ένας ιός RNA που μεταδίδεται από αρθρόποδα, μονόκλωνος και χωρίζεται σε τρία μέρη: μικρό, μεσαίο και μεγάλο. Αυτά τα τρία τμήματα κωδικοποιούν βασικά συστατικά που απαιτούνται για την ανάπτυξη, τη μετάδοση και τη μολυσματικότητα του ιού.

ΜετάΟ ιός που εντοπίστηκε για πρώτη φορά στο Τρινιντάντ και Τομπάγκο το 1955, έχει προκαλέσει πολλές εστίες σε ζώα (πρωτεύοντα πλην του ανθρώπου, νωθρούς και πτηνά) στη λεκάνη του Αμαζονίου. Στον άνθρωπο, ο ιός μεταδίδεται κυρίως από τα κουνούπια (κουνούπιαCulicoides paraenesis) και προκαλεί ήπιες έως μέτριες λοιμώξεις που υποχωρούν μέσα σε μια εβδομάδα.

Από τον Αύγουστο του 2024, έχουν αναφερθεί περίπου 30 κρούσματα στη Λατινική Αμερική. Ωστόσο, πρόσφατα επιδημιολογικά δεδομένα δείχνουν μια απότομη αύξηση των κρουσμάτων OROV σε αρκετές μη ενδημικές πολιτείες της Βραζιλίας, με περιπτώσεις που αναφέρθηκαν στην Ιταλία, την Ισπανία και τη Γερμανία από ταξιδιώτες που επισκέφθηκαν την Κούβα.

Τα τρία πρώτα θανατηφόρα κρούσματα μολύνσεων από OVOV αναφέρθηκαν επίσης στη Βραζιλία το 2024. Όλες αυτές οι αναφορές υπογραμμίζουν την εξάπλωση του ιού εκτός του Αμαζονίου και εγείρουν ανησυχίες στους αξιωματούχους της δημόσιας υγείας.

Σχεδιασμός μελέτης

Οι ερευνητές πραγματοποίησαν αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος δειγμάτων προερχόμενων από ασθενείς μολυσμένα με Orov που συλλέχθηκαν από πέντε πολιτείες της Βραζιλίας μεταξύ Φεβρουαρίου και Μαΐου 2024. Επέλεξαν τα δείγματα για γονιδιωματική ανάλυση με βάση τα διαθέσιμα κλινικά και επιδημιολογικά μεταδεδομένα.

Δημιούργησαν 133 αλληλουχίες ολόκληρου του γονιδιώματος που καλύπτουν τα τρία γονιδιωματικά τμήματα του ιού: τα μικρά, τα μεσαία και τα μεγάλα τμήματα. Αυτές οι αλληλουχίες περιελάμβαναν τα πρώτα γονιδιώματα από περιοχές εκτός του Αμαζονίου και από τις πρώτες καταγεγραμμένες περιπτώσεις.

Αποτελέσματα μελέτης

Οι ερευνητές συνέδεσαν την καλλιέργεια μπανάνας και κακάο με τα μέτρια κατώφλια πληθυσμού, δημιουργώντας ιογενείς εστίες όπου η αποψίλωση των δασών αντιστοιχεί στη γεωργία.

Η μελέτη ανέφερε μια απότομη αύξηση των ανθρώπινων μολύνσεων από OROV στην περιοχή του δυτικού Αμαζονίου μεταξύ τέλους 2022 και αρχών 2024. Αυτή η επαγωγή συνέπεσε με αύξηση της συχνότητας δοκιμών OROV (από 238 τεστ το 2020 σε 54.428 στις αρχές του 2024) σε όλη τη χώρα, υποδεικνύοντας ότι οι προσπάθειες εντατικοποιήθηκαν.

Η φυλογενετική ανάλυση αποκάλυψε ότι οι νέες αλληλουχίες ιών που δημιουργήθηκαν στη μελέτη μοιράζονται έναν κοινό πρόγονο με αλληλουχίες που λαμβάνονται από τη λεκάνη του Αμαζονίου από το 2022, υποδηλώνοντας μια πιθανή προέλευση του Αμαζονίου της πιο πρόσφατης ιικής γενεαλογίας.

Λόγω του τμηματοποιημένου μοτίβου του, το γονιδίωμα OROV είναι πιθανό να υποβληθεί σε γεγονότα επανεκτύπωσης και ανασυνδυασμού. Η μελέτη εντόπισε 21 γεγονότα μεταρρύθμισης (συμπεριλαμβανομένων 17 μεταρρυθμίσεων SM, 7 SL και 11 ML). Αν αυτές οι γονιδιωματικές αλλαγές διευκόλυναν την προσαρμογή του ιού σε τοπικές οικολογικές ασθένειες ή συνέβαλαν στη μολυσματικότητα και την παθογένειά τους παρέμεινε ασαφές.

Πραγματοποιώντας μια φυλογεωγραφική ανακατασκευή του συνόλου δεδομένων της Βραζιλίας 2022-2024 μαζί με πρόσφατα απομονωμένες διεθνείς αλληλουχίες γονιδιώματος από το Περού και την Ιταλία, η μελέτη βρήκε ταχεία μετάδοση ιών από Βορρά προς Νότο στη Βραζιλία, ακολουθούμενη από διασυνοριακή μετάδοση στο Περού.

Η μελέτη διαπίστωσε επίσης ότι οι περιπτώσεις Orov που αναφέρθηκαν στην Ιταλία συνδέονται με ταξιδιώτες που επέστρεψαν από την Κούβα. Ωστόσο, οι περιπτώσεις της Κούβας συνάγονται αποκλειστικά από το ιστορικό ταξιδιού, επειδή τα γονιδιωματικά δεδομένα από την ίδια την Κούβα δεν είναι διαθέσιμα, περιορίζοντας τα οριστικά συμπεράσματα σχετικά με τις διαδρομές μετάδοσης. Αυτές οι παρατηρήσεις υπογραμμίζουν το ρόλο της ανθρώπινης κινητικότητας στην εξάπλωση του ιού.

Διερευνήστε τη σημασία

Ενώ οι περισσότερες λοιμώξεις υποχωρούν μέσα σε μια εβδομάδα, ο πρώτος τεκμηριωμένος θάνατος που σχετίζεται με το OROV εγείρει συναγερμούς σχετικά με κινδύνους κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης.

Η μελέτη δείχνει πώς η εξέλιξη του OROV μέσω γονιδιωματικών μεταρρυθμίσεων διευκόλυνε την ταχεία μετάδοσή του εντός και εκτός της Βραζιλίας. Τα αποτελέσματα δείχνουν ότι μεταξύ 2010 και 2014, η γενεαλογία 2022-2024 εμφανίστηκε στον κεντρικό Αμαζόνιο, με στοιχεία ενός μακροπρόθεσμου κρυπτικού κύκλου στον Αμαζόνιο στα τέλη της δεκαετίας του 2010 με βάση περιορισμένη παρακολούθηση.

Η κίνηση του ιού από Βορρά προς Νότο της μελέτης συμπίπτει με την εποχή των βροχών της λεκάνης του Αμαζονίου. Οι υπάρχουσες οικολογικές επιδημιολογικές μελέτες δείχνουν ότι το Orov κυκλοφορεί κατά προτίμηση σε περιοχές με υψηλή πληθυσμιακή πυκνότητα, ευνοϊκές κλιματικές συνθήκες και μειωμένη αειθαλή ευρεία δασική κάλυψη.

Επιπλέον, η αποψίλωση των δασών, η αστικοποίηση και οι γεωργικές πρακτικές (π.
Η ανίχνευση των τριών πρώτων θανατηφόρων περιπτώσεων Orov σε νεαρούς ενήλικες χωρίς συννοσηρότητες – συμπεριλαμβανομένων μεταλλάξεων στα τμήματα M (I13V, M642I) και L (T857A) – υπογραμμίζει την ανάγκη για περαιτέρω έρευνα με ιδιαίτερη έμφαση στην κάθετη μετάδοση και τα αποτελέσματα της εγκυμοσύνης.

Το Υπουργείο Υγείας της Βραζιλίας ανέφερε πρόσφατα τον πρώτο εμβρυϊκό θάνατο λόγω του Orov με μετάδοση από μητέρα σε παιδί στο Pernambuco. Ωστόσο, οι ασυμπτωματικές ή ήπιες περιπτώσεις μπορεί να υποεκπροσωπούνται σε σύνολα δεδομένων γονιδιώματος, με αποτέλεσμα οι προσπάθειες επιτήρησης να μεροληπτούν. Αυτό υπογραμμίζει την ανάγκη εντοπισμού ιογενών παραγόντων που σχετίζονται με σοβαρά αποτελέσματα και ανάπτυξης αποτελεσματικών παρεμβάσεων.

Η μελέτη εντόπισε περιπτώσεις που σχετίζονται με το ORROV που συνδέονται με ταξίδια, υποδηλώνοντας ότι η ανθρώπινη κινητικότητα παίζει σημαντικό ρόλο στην εξάπλωση του ιού σε ολόκληρη τη Βραζιλία. Οι βασικοί περιορισμοί περιλαμβάνουν την έλλειψη γονιδιωματικών δεδομένων από την Κολομβία, την Κούβα και άλλες πληγείσες χώρες, γεγονός που εμποδίζει την πλήρη κατανόηση των δικτύων μεταφοράς.

Συνολικά, η μελέτη υπογραμμίζει την επείγουσα ανάγκη για συνεχή γονιδιωματική επιτήρηση για την κατανόηση της εξελικτικής και επιδημιολογικής δυναμικής του OOV. Αυτό είναι ιδιαίτερα σημαντικό για την πρόληψη μελλοντικών εστιών και για τη διασφάλιση έγκαιρων απαντήσεων στη δημόσια υγεία.

Πηγές: