Virus Oropouche postaje globalan: Studija sadrži nove rizike od reformi virusa

Virus Oropouche postaje globalan: Studija sadrži nove rizike od reformi virusa

Nova studija pokazuje kako se virus Oropouche probio iz Amazone i proširio u Brazil i šire. Znanstvenici upozoravaju da promjene u okolišu, mobilnost ljudi i evolucija virusa pokreću njegovu brzu ekspanziju – i rastuću zabrinutost za globalno javno zdravlje.

Virus Oropouche (OOV), povijesno ograničen na brazilski bazen Amazone, izazvao je višestruke epidemije u mnogim brazilskim državama od 2022. Nedavno su mnogi slučajevi Orova otkriveni i izvan Brazila.

Istraživači su proveli sekvencioniranje cijelog genoma izolata virusa iz područja epidemije kako bi razumjeli dinamiku prijenosa virusa u neendemske regije. Studija je objavljena uČasopis putne medicine.

pozadina

Virus je vjerojatno kružio neotkriven Amazonom više od desetljeća, s genomskim tragovima koji ukazuju na tiho širenje već 2010.-2014. zbog nedosljednog nadzora.

Oropouche virus (OOV) je jednolančani RNA virus koji se prenosi člankonošcima i koji je segmentiran u tri dijela: mali, srednji i veliki. Ova tri segmenta kodiraju bitne komponente potrebne za rast, prijenos i infektivnost virusa.

NakonPrvi put otkriven u Trinidadu i Tobagu 1955. godine, virus je izazvao nekoliko epidemija kod životinja (neljudskih primata, ljenjivaca i ptica) u slivu Amazone. Kod ljudi virus prvenstveno prenose komarci (komarci (Culicoides paraenesis) i uzrokuje blage do umjerene infekcije koje prolaze unutar tjedan dana.

Od kolovoza 2024. u Latinskoj Americi je prijavljeno približno 30 izbijanja. Međutim, nedavni epidemiološki podaci pokazuju nagli porast slučajeva OROV-a u nekoliko neendemskih brazilskih država, sa slučajevima prijavljenim u Italiji, Španjolskoj i Njemačkoj od putnika koji posjećuju Kubu.

Prva tri fatalna slučaja infekcije OVOV-om također su prijavljena u Brazilu 2024. Sva ova izvješća naglašavaju širenje virusa izvan Amazone i izazivaju zabrinutost među službenicima javnog zdravstva.

Dizajn studije

Istraživači su proveli sekvenciranje cijelog genoma uzoraka dobivenih od pacijenata zaraženih Orovom prikupljenih iz pet brazilskih država između veljače i svibnja 2024. Odabrali su uzorke za genomsku analizu na temelju dostupnih kliničkih i epidemioloških metapodataka.

Generirali su 133 sekvence cijelog genoma koje pokrivaju tri genomska segmenta virusa: mali, srednji i veliki segment. Ove sekvence uključivale su prve genome iz regija izvan Amazone i iz prvih zabilježenih slučajeva.

Rezultati studije

Istraživači su povezali uzgoj banana i kakaovca s pragovima populacije mušica, stvarajući žarišta virusa gdje krčenje šuma odgovara poljoprivredi.

Studija je izvijestila o oštrom porastu ljudskih OROV infekcija u zapadnoj amazonskoj regiji između kraja 2022. i početka 2024. Ova indukcija koincidirala je s povećanjem učestalosti testiranja OROV (s 238 testova u 2020. na 54 428 početkom 2024.) u cijeloj zemlji, što ukazuje na pojačane napore u nadzoru.

Filogenetska analiza otkrila je da nove sekvence virusa generirane u studiji dijele zajedničkog pretka sa sekvencama dobivenim iz bazena Amazone od 2022., što ukazuje na moguće amazonsko podrijetlo najnovije virusne loze.

Zbog svog segmentiranog uzorka, OROV genom će vjerojatno biti podvrgnut događajima ponovnog ispisa i rekombinacije. Studija je identificirala 21 reformski događaj (uključujući 17 SM, 7 SL i 11 ML reformi). Ostalo je nejasno jesu li te genomske promjene olakšale prilagodbu virusa na lokalne ekološke bolesti ili pridonijele njihovoj infektivnosti i patogenosti.

Izvođenjem filogeografske rekonstrukcije brazilskog skupa podataka 2022.-2024. zajedno s nedavno izoliranim međunarodnim sekvencama genoma iz Perua i Italije, studija je otkrila brz prijenos virusa sa sjevera na jug unutar Brazila, nakon čega je uslijedio prekogranični prijenos u Peruu.

Studija je također otkrila da su slučajevi Orova prijavljeni u Italiji povezani s putnicima koji su se vratili s Kube. Međutim, kubanski slučajevi izvedeni su isključivo iz povijesti putovanja jer genomski podaci sa same Kube nisu dostupni, što ograničava konačne zaključke o putovima prijenosa. Ova opažanja naglašavaju ulogu ljudske mobilnosti u širenju virusa.

Istražite značaj

Dok se većina infekcija povlači unutar tjedan dana, prva dokumentirana smrt povezana s OROV-om izaziva uzbunu o rizicima tijekom trudnoće.

Studija pokazuje kako je evolucija OROV-a kroz genomske reforme omogućila njegov brzi prijenos unutar i izvan Brazila. Rezultati pokazuju da se između 2010. i 2014. loza 2022. – 2024. pojavila u središnjoj Amazoni, s dokazima dugotrajnog kriptičnog ciklusa u Amazoni u kasnim 2010-ima na temelju ograničenog praćenja.

Kretanje virusa od sjevera prema jugu poklapa se s kišnom sezonom u amazonskom bazenu. Postojeće eko-epidemiološke studije sugeriraju da Orov prvenstveno cirkulira u regijama s visokom gustoćom naseljenosti, povoljnim klimatskim uvjetima i smanjenim zimzelenim širokim šumskim pokrovom.

Osim toga, sječa šuma, urbanizacija i poljoprivredna praksa (npr. uzgoj banana i kakaovca) olakšavaju razmnožavanje mušica, čime se povećava rizik od prijenosa virusa i oblikuje geografsko područje širenja virusa.
Otkrivanje prva tri fatalna slučaja Orova kod mladih odraslih osoba bez komorbiditeta – uključujući mutacije u segmentima M (I13V, M642I) i L (T857A) – naglašava potrebu za daljnjim istraživanjem s posebnim fokusom na vertikalni prijenos i ishode trudnoće.

Brazilsko Ministarstvo zdravstva nedavno je izvijestilo o prvoj fetalnoj smrti uzrokovanoj Orovom s prijenosom s majke na dijete u Pernambucu. Međutim, asimptomatski ili blagi slučajevi mogu biti nedovoljno zastupljeni u skupovima genomskih podataka, što dovodi do pristranosti u naporima nadzora. Ovo naglašava potrebu za identificiranjem virusnih čimbenika povezanih s teškim ishodima i razvojem učinkovitih intervencija.

Studija je identificirala slučajeve povezane s ORROV-om povezane s putovanjem, sugerirajući da ljudska mobilnost igra važnu ulogu u širenju virusa Brazilom. Ključna ograničenja uključuju nedostatak genomskih podataka iz Kolumbije, Kube i drugih pogođenih zemalja, što sprječava potpuno razumijevanje prijenosnih mreža.

Sve u svemu, studija naglašava hitnost kontinuiranog genomskog nadzora kako bi se razumjela evolucijska i epidemiološka dinamika OOV-a. Ovo je osobito važno kako bi se spriječile buduće epidemije i osigurale pravovremene javnozdravstvene reakcije.

Izvori: