Il virus Oropouche diventa globale: lo studio contiene nuovi rischi derivanti dalle riforme sul virus

Il virus Oropouche diventa globale: lo studio contiene nuovi rischi derivanti dalle riforme sul virus

Un nuovo studio mostra come il virus Oropouche sia uscito dall’Amazzonia e si sia diffuso in Brasile e oltre. Gli scienziati avvertono che i cambiamenti ambientali, la mobilità umana e l’evoluzione virale stanno guidando la sua rapida espansione – e pressanti preoccupazioni per la salute pubblica globale.

Il virus Oropouche (OOV), storicamente limitato al bacino amazzonico brasiliano, ha causato numerosi focolai in molti stati brasiliani dal 2022. Recentemente, molti casi Orov sono stati scoperti al di fuori del Brasile.

I ricercatori hanno condotto il sequenziamento dell’intero genoma degli isolati virali dalle regioni colpite dall’epidemia per comprendere le dinamiche della trasmissione del virus alle regioni non endemiche. Lo studio è pubblicato nelGiornale di medicina di viaggio.

sfondo

Probabilmente il virus è circolato inosservato in Amazzonia per oltre un decennio, con tracce genomiche che indicavano una diffusione silenziosa già nel 2010-2014 a causa di una sorveglianza incoerente.

Il virus Oropouche (OOV) è un virus RNA a filamento singolo trasmesso da artropodi, segmentato in tre parti: piccola, media e grande. Questi tre segmenti codificano componenti essenziali necessari per la crescita, la trasmissione e l’infettività del virus.

DopoRilevato per la prima volta a Trinidad e Tobago nel 1955, il virus ha causato diversi focolai negli animali (primati non umani, bradipi e uccelli) nel bacino amazzonico. Negli esseri umani, il virus viene trasmesso principalmente dalle zanzare (zanzare (Culicoides paraenesi) e causa infezioni da lievi a moderate che si risolvono entro una settimana.

Ad agosto 2024, in America Latina sono stati segnalati circa 30 focolai. Tuttavia, recenti dati epidemiologici mostrano un forte aumento dei casi OROV in diversi stati brasiliani non endemici, con casi segnalati in Italia, Spagna e Germania da viaggiatori in visita a Cuba.

I primi tre casi mortali di infezioni da OVOV sono stati segnalati anche in Brasile nel 2024. Tutti questi rapporti sottolineano la diffusione del virus al di fuori dell’Amazzonia e sollevano preoccupazioni tra i funzionari della sanità pubblica.

Progettazione dello studio

I ricercatori hanno effettuato il sequenziamento dell’intero genoma di campioni derivati ​​da pazienti infetti da Orov raccolti da cinque stati brasiliani tra febbraio e maggio 2024. Hanno selezionato i campioni per l’analisi genomica sulla base dei metadati clinici ed epidemiologici disponibili.

Hanno generato 133 sequenze dell’intero genoma che coprono i tre segmenti genomici del virus: i segmenti piccoli, medi e grandi. Queste sequenze includevano i primi genomi provenienti da regioni esterne all’Amazzonia e dai primi casi registrati.

Risultati dello studio

I ricercatori hanno collegato la coltivazione di banane e cacao alle soglie di popolazione dei moscerini, creando hotspot virali dove la deforestazione corrisponde all’agricoltura.

Lo studio ha riportato un forte aumento delle infezioni umane da OROV nella regione amazzonica occidentale tra la fine del 2022 e l’inizio del 2024. Questa induzione ha coinciso con un aumento della frequenza dei test OROV (da 238 test nel 2020 a 54.428 all’inizio del 2024) in tutto il paese, indicando sforzi di sorveglianza intensificati.

L’analisi filogenetica ha rivelato che le nuove sequenze virali generate nello studio condividono un antenato comune con sequenze ottenute dal bacino amazzonico dal 2022, suggerendo una possibile origine amazzonica del lignaggio virale più recente.

A causa del suo modello segmentato, è probabile che il genoma OROV subisca eventi di ristampa e ricombinazione. Lo studio ha individuato 21 eventi di riforma (tra cui 17 riforme SM, 7 SL e 11 ML). Non era chiaro se questi cambiamenti genomici facilitassero l’adattamento virale alle malattie ecologiche locali o contribuissero alla loro infettività e patogenicità.

Eseguendo una ricostruzione filogeografica del set di dati brasiliano del periodo 2022-2024 insieme alle sequenze genomiche internazionali recentemente isolate dal Perù e dall’Italia, lo studio ha rilevato una rapida trasmissione virale da nord a sud all’interno del Brasile, seguita dalla trasmissione transfrontaliera in Perù.

Lo studio ha anche scoperto che i casi di Orov segnalati in Italia sono collegati a viaggiatori tornati da Cuba. Tuttavia, i casi cubani vengono dedotti esclusivamente dalla cronologia dei viaggi perché i dati genomici provenienti da Cuba stessa non sono disponibili, limitando le conclusioni definitive sulle vie di trasmissione. Queste osservazioni evidenziano il ruolo della mobilità umana nella diffusione del virus.

Indagare sul significato

Mentre la maggior parte delle infezioni si risolve entro una settimana, la prima morte documentata correlata all’OROV solleva allarmi sui rischi durante la gravidanza.

Lo studio mostra come l’evoluzione dell’OROV attraverso le riforme genomiche abbia facilitato la sua rapida trasmissione all’interno e all’esterno del Brasile. I risultati mostrano che tra il 2010 e il 2014, il lignaggio 2022-2024 è emerso nell’Amazzonia centrale, con prove di un ciclo criptico a lungo termine in Amazzonia alla fine degli anni 2010 sulla base di un monitoraggio limitato.

Il movimento del virus da nord a sud, secondo lo studio, coincide con la stagione delle piogge del bacino amazzonico. Gli studi ecoepidemiologici esistenti suggeriscono che Orov circola preferenzialmente in regioni con alta densità di popolazione, condizioni climatiche favorevoli e ridotta copertura forestale sempreverde.

Inoltre, la deforestazione, l’urbanizzazione e le pratiche agricole (ad esempio, la coltivazione di banane e cacao) facilitano la riproduzione dei moscerini, aumentando così il rischio di trasmissione del virus e modellando la portata geografica del virus.
Il rilevamento dei primi tre casi fatali di Orov in giovani adulti senza comorbilità – comprese le mutazioni nei segmenti M (I13V, M642I) e L (T857A) – evidenzia la necessità di ulteriori indagini con particolare attenzione alla trasmissione verticale e agli esiti della gravidanza.

Il Ministero della Salute brasiliano ha recentemente segnalato la prima morte fetale dovuta a Orov con trasmissione da madre a figlio a Pernambuco. Tuttavia, i casi asintomatici o lievi possono essere sottorappresentati nei set di dati genomici, influenzando gli sforzi di sorveglianza. Ciò evidenzia la necessità di identificare i fattori virali associati a esiti gravi e di sviluppare interventi efficaci.

Lo studio ha identificato casi correlati all’ORROV legati ai viaggi, suggerendo che la mobilità umana gioca un ruolo importante nella diffusione del virus in tutto il Brasile. Le limitazioni principali includono la mancanza di dati genomici provenienti da Colombia, Cuba e altri paesi colpiti, che impedisce una comprensione completa delle reti di trasmissione.

Nel complesso, lo studio evidenzia l’urgenza di una sorveglianza genomica continua per comprendere le dinamiche evolutive ed epidemiologiche dell’OOV. Ciò è particolarmente importante per prevenire future epidemie e garantire risposte tempestive in materia di sanità pubblica.

Fonti: