Oropouche virusas plinta visame pasaulyje: tyrime yra naujų virusų reformų keliamų pavojų

Oropouche virusas plinta visame pasaulyje: tyrime yra naujų virusų reformų keliamų pavojų

Naujas tyrimas rodo, kaip Oropouche virusas išsiveržė iš Amazonės ir išplito į Braziliją ir už jos ribų. Mokslininkai perspėja, kad aplinkos pokyčiai, žmonių mobilumas ir virusų evoliucija skatina jos sparčią plėtrą ir kelia visuotinį visuomenės sveikatos susirūpinimą.

Oropouche virusas (OOV), istoriškai apsiribojęs Brazilijos Amazonės baseinu, nuo 2022 m. sukėlė daugybę protrūkių daugelyje Brazilijos valstijų. Pastaruoju metu daug Orovo atvejų buvo aptikta už Brazilijos ribų.

Tyrėjai atliko viso genomo viruso izoliatų seką iš protrūkio regionų, kad suprastų viruso perdavimo į ne endeminius regionus dinamiką. Tyrimas paskelbtasKelionių medicinos žurnalas.

fone

Virusas greičiausiai nepastebėtas Amazonėje plito daugiau nei dešimtmetį, o genominiai pėdsakai rodo tylų plitimą jau 2010–2014 m. dėl nenuoseklaus stebėjimo.

Oropouche virusas (OOV) yra nariuotakojų platinamas vienos grandinės RNR virusas, suskirstytas į tris dalis: mažą, vidutinę ir didelę. Šie trys segmentai koduoja esminius komponentus, reikalingus viruso augimui, perdavimui ir užkrečiamumui.

Po toPirmą kartą Trinidade ir Tobage aptiktas 1955 m. virusas sukėlė keletą gyvūnų (nežmoginių primatų, tinginių ir paukščių) protrūkių Amazonės baseine. Žmonėms virusą daugiausia perduoda uodai (uodai,Culicoides paraenesis) ir sukelia lengvas ar vidutinio sunkumo infekcijas, kurios praeina per savaitę.

2024 m. rugpjūčio mėn. buvo pranešta apie maždaug 30 protrūkių Lotynų Amerikoje. Tačiau naujausi epidemiologiniai duomenys rodo, kad keliose ne endeminėse Brazilijos valstijose smarkiai padaugėjo OROV atvejų, o Italijoje, Ispanijoje ir Vokietijoje apie Kubą lankančių keliautojų atvejus.

2024 m. Brazilijoje taip pat buvo pranešta apie pirmuosius tris mirtinus OVOV infekcijų atvejus. Visi šie pranešimai pabrėžia viruso plitimą už Amazonės ribų ir kelia visuomenės sveikatos pareigūnų susirūpinimą.

Studijų dizainas

2024 m. vasario–gegužės mėn. mokslininkai atliko viso genomo sekos nustatymą Orov infekuotų pacientų mėginiams, paimtiems iš penkių Brazilijos valstijų. Jie atrinko mėginius genomo analizei, remdamiesi turimais klinikiniais ir epidemiologiniais metaduomenimis.

Jie sukūrė 133 viso genomo sekas, apimančias tris genominius viruso segmentus: mažus, vidutinius ir didelius segmentus. Šios sekos apėmė pirmuosius genomus iš regionų už Amazonės ribų ir iš pirmųjų užfiksuotų atvejų.

Studijų rezultatai

Tyrėjai susiejo bananų ir kakavos auginimą su vidutinių populiacijų slenksčiais, sukurdami virusines vietas, kur miškų naikinimas atitinka žemės ūkį.

Tyrimas parodė, kad nuo 2022 m. pabaigos iki 2024 m. pradžios Vakarų Amazonės regione smarkiai išaugo žmonių OROV infekcijų skaičius. Ši indukcija sutapo su OROV tyrimų dažnio padidėjimu (nuo 238 testų 2020 m. iki 54 428 2024 m. pradžioje), o tai rodo, kad reikia intensyviau stebėti.

Filogenetinė analizė atskleidė, kad tyrime sukurtos naujos virusų sekos turi bendrą protėvį su sekomis, gautomis iš Amazonės baseino nuo 2022 m., o tai rodo galimą naujausios virusinės kilmės Amazonės kilmę.

Dėl savo segmentuoto modelio OROV genomas greičiausiai bus perspausdintas ir rekombinuotas. Tyrimo metu nustatytas 21 reformos įvykis (iš jų 17 SM, 7 SL ir 11 ML reformų). Ar šie genominiai pokyčiai palengvino virusų prisitaikymą prie vietinių ekologinių ligų, ar prisidėjo prie jų užkrečiamumo ir patogeniškumo, liko neaišku.

Atlikus 2022–2024 m. Brazilijos duomenų rinkinio filogeografinę rekonstrukciją kartu su neseniai išskirtomis tarptautinėmis genomo sekomis iš Peru ir Italijos, tyrimas nustatė greitą viruso plitimą iš šiaurės į pietus Brazilijoje, o po to – tarpvalstybinį perdavimą Peru.

Tyrimas taip pat parodė, kad Orovo atvejai, apie kuriuos pranešta Italijoje, yra susiję su keliautojais, grįžusiais iš Kubos. Tačiau Kubos atvejai yra numanomi tik iš kelionių istorijos, nes pačios Kubos genominių duomenų nėra, o tai riboja galutines išvadas apie perdavimo maršrutus. Šie stebėjimai pabrėžia žmogaus mobilumo vaidmenį viruso plitimui.

Ištirkite reikšmę

Nors dauguma infekcijų išnyksta per savaitę, pirmoji dokumentuota mirtis, susijusi su OROV, kelia pavojų nėštumo metu.

Tyrimas rodo, kaip OROV evoliucija per genomo reformas palengvino greitą jo perdavimą Brazilijoje ir už jos ribų. Rezultatai rodo, kad 2010–2014 m. 2022–2024 m. giminė atsirado centrinėje Amazonės dalyje, o 2010-ųjų pabaigoje Amazonėje buvo ilgalaikis paslaptingas ciklas, pagrįstas ribotu stebėjimu.

Tyrimo viruso judėjimas iš šiaurės į pietus sutampa su lietaus sezonu Amazonės baseine. Esami ekoepidemiologiniai tyrimai rodo, kad Orovas pirmiausia cirkuliuoja regionuose, kuriuose yra didelis gyventojų tankis, palankios klimato sąlygos ir sumažėjęs visžalių plataus miško plotas.

Be to, miškų naikinimas, urbanizacija ir žemės ūkio praktika (pvz., bananų ir kakavos auginimas) palengvina dygliuočių veisimąsi, taip padidindami viruso perdavimo riziką ir formuodami viruso geografinį diapazoną.
Pirmųjų trijų mirtinų Orovo atvejų aptikimas jauniems suaugusiems, nesergantiems gretutinių ligų, įskaitant mutacijas M (I13V, M642I) ir L (T857A) segmentuose, pabrėžia tolesnio tyrimo poreikį, ypatingą dėmesį skiriant vertikaliam perdavimui ir nėštumo rezultatams.

Brazilijos sveikatos apsaugos ministerija neseniai pranešė apie pirmąją vaisiaus mirtį, kurią sukėlė Orovas, persiduodant iš motinos vaikui Pernambuke. Tačiau besimptomiai arba lengvi atvejai genominiuose duomenų rinkiniuose gali būti nepakankamai vaizduojami, todėl stebėjimo pastangos yra šališkos. Tai pabrėžia būtinybę nustatyti virusinius veiksnius, susijusius su sunkiais rezultatais, ir sukurti veiksmingas intervencijas.

Tyrimas nustatė su ORROV susijusius atvejus, susijusius su kelionėmis, o tai rodo, kad žmonių mobilumas vaidina svarbų vaidmenį viruso plitimui Brazilijoje. Pagrindiniai apribojimai apima genominių duomenų iš Kolumbijos, Kubos ir kitų paveiktų šalių trūkumą, o tai neleidžia visiškai suprasti perdavimo tinklų.

Apskritai tyrime pabrėžiama, kad būtina skubiai vykdyti nuolatinę genominę priežiūrą, kad būtų galima suprasti OOV evoliucinę ir epidemiologinę dinamiką. Tai ypač svarbu siekiant užkirsti kelią būsimiems protrūkiams ir užtikrinti savalaikį visuomenės sveikatos atsaką.

Šaltiniai: