Oropouche vīruss kļūst globāls: pētījums ietver jaunus vīrusu reformu riskus

Oropouche vīruss kļūst globāls: pētījums ietver jaunus vīrusu reformu riskus

Jauns pētījums parāda, kā Oropouche vīruss izlauzās no Amazones un izplatījās Brazīlijā un ārpus tās. Zinātnieki brīdina, ka vides pārmaiņas, cilvēku mobilitāte un vīrusu evolūcija veicina tās straujo paplašināšanos un rada globālas sabiedrības veselības problēmas.

Oropouche vīruss (OOV), kas vēsturiski ir ierobežots Brazīlijas Amazones baseinā, kopš 2022. gada ir izraisījis vairākus uzliesmojumus daudzos Brazīlijas štatos. Pēdējā laikā daudzi Orova gadījumi ir atklāti ārpus Brazīlijas.

Pētnieki ir veikuši vīrusu izolātu no uzliesmojuma reģioniem visa genoma sekvencēšanu, lai izprastu vīrusa pārnešanas dinamiku uz neendēmiskiem reģioniem. Pētījums ir publicētsCeļojumu medicīnas žurnāls.

fons

Vīruss, visticamāk, Amazonē neatklāts cirkulēja vairāk nekā desmit gadus, un genoma pēdas liecina par klusu izplatību jau 2010.–2014. gadā nekonsekventas uzraudzības dēļ.

Oropouche vīruss (OOV) ir posmkāju pārnēsāts, vienpavedienu RNS vīruss, kas ir sadalīts trīs daļās: mazā, vidējā un lielā. Šie trīs segmenti kodē būtiskas sastāvdaļas, kas nepieciešamas vīrusa augšanai, pārnešanai un infekciozitātei.

PēcVīruss pirmo reizi tika atklāts Trinidādā un Tobāgo 1955. gadā, un tas ir izraisījis vairākus uzliesmojumus dzīvniekiem (primātiem, kas nav cilvēkveidīgie primāti, sliņķi un putni) Amazones baseinā. Cilvēkiem vīrusu pārnēsā galvenokārt odi (odiCulicoides paraenesis) un izraisa vieglas vai vidēji smagas infekcijas, kas izzūd nedēļas laikā.

2024. gada augustā Latīņamerikā ir ziņots par aptuveni 30 uzliesmojumiem. Tomēr jaunākie epidemioloģiskie dati liecina par strauju OROV gadījumu pieaugumu vairākos neendēmiskajos Brazīlijas štatos, un Itālijā, Spānijā un Vācijā par gadījumiem ziņots no ceļotājiem, kuri apmeklē Kubu.

Pirmie trīs nāvējošie OVOV infekciju gadījumi tika ziņots arī Brazīlijā 2024. gadā. Visi šie ziņojumi uzsver vīrusa izplatību ārpus Amazones un rada bažas sabiedrības veselības amatpersonu vidū.

Studiju dizains

Pētnieki veica visa genoma sekvencēšanu ar Orovu inficētiem pacientiem, kas iegūti no pieciem Brazīlijas štatiem no 2024. gada februāra līdz maijam. Viņi atlasīja paraugus genoma analīzei, pamatojoties uz pieejamajiem klīniskajiem un epidemioloģiskajiem metadatiem.

Viņi radīja 133 visa genoma sekvences, kas aptver trīs vīrusa genoma segmentus: mazos, vidējos un lielos segmentus. Šīs sekvences ietvēra pirmos genomus no reģioniem ārpus Amazones un no pirmajiem reģistrētajiem gadījumiem.

Studiju rezultāti

Pētnieki saistīja banānu un kakao audzēšanu ar vidējo iedzīvotāju skaita sliekšņiem, radot vīrusu karstos punktus, kur mežu izciršana atbilst lauksaimniecībai.

Pētījumā tika ziņots par strauju cilvēku OROV infekciju pieaugumu Amazones rietumu reģionā no 2022. gada beigām līdz 2024. gada sākumam. Šī indukcija sakrita ar OROV testu biežuma palielināšanos (no 238 testiem 2020. gadā līdz 54 428 2024. gada sākumā), kas liecina par pastiprinātiem uzraudzības centieniem.

Filoģenētiskā analīze atklāja, ka pētījumā radītajām jaunajām vīrusu sekvencēm ir kopīgs priekštecis ar sekvencēm, kas iegūtas no Amazones baseina kopš 2022. gada, kas liecina par iespējamu jaunākās vīrusu cilmes Amazones izcelsmi.

Segmentētā modeļa dēļ OROV genoms, iespējams, tiks atkārtoti drukāts un rekombinēts. Pētījumā tika identificēts 21 reformas notikums (tostarp 17 SM, 7 SL un 11 ML reformas). Joprojām nav skaidrs, vai šīs genoma izmaiņas veicināja vīrusu pielāgošanos vietējām ekoloģiskajām slimībām vai veicināja to infekciozitāti un patogenitāti.

Veicot 2022.–2024. gada Brazīlijas datu kopas filoģeogrāfisko rekonstrukciju, kā arī nesen izolētās starptautiskās genoma sekvences no Peru un Itālijas, pētījums atklāja ātru vīrusu pārnešanu no ziemeļiem uz dienvidiem Brazīlijā, kam sekoja pārrobežu pārnešana Peru.

Pētījumā arī konstatēts, ka Orova gadījumi, par kuriem ziņots Itālijā, ir saistīti ar ceļotājiem, kuri atgriezušies no Kubas. Tomēr Kubas gadījumi tiek secināti tikai no ceļojumu vēstures, jo pašas Kubas genoma dati nav pieejami, ierobežojot galīgos secinājumus par pārraides ceļiem. Šie novērojumi izceļ cilvēka mobilitātes lomu vīrusa izplatībā.

Izpētiet nozīmi

Lai gan lielākā daļa infekciju izzūd nedēļas laikā, pirmā dokumentētā ar OROV saistīta nāve rada trauksmi par riskiem grūtniecības laikā.

Pētījums parāda, kā OROV evolūcija, izmantojot genoma reformas, ir veicinājusi tā ātru pārnešanu Brazīlijā un ārpus tās. Rezultāti liecina, ka no 2010. līdz 2014. gadam Amazones centrālajā daļā parādījās 2022.–2024. gada ciltsraksts, un 2010. gadu beigās ir pierādījumi par ilgstošu noslēpumainu ciklu Amazonē, pamatojoties uz ierobežotu uzraudzību.

Pētījuma vīrusu kustība no ziemeļiem uz dienvidiem sakrīt ar Amazones baseina lietus sezonu. Esošie ekoepidemioloģiskie pētījumi liecina, ka Orovs galvenokārt cirkulē reģionos ar augstu iedzīvotāju blīvumu, labvēlīgiem klimatiskajiem apstākļiem un samazinātu mūžzaļo plašu meža segumu.

Turklāt mežu izciršana, urbanizācija un lauksaimniecības prakse (piemēram, banānu un kakao audzēšana) veicina punduru vairošanos, tādējādi palielinot vīrusa pārnešanas risku un veidojot vīrusa ģeogrāfisko diapazonu.
Pirmo trīs letālo Orova gadījumu atklāšana jauniem pieaugušajiem bez blakusslimībām, tostarp mutācijām M (I13V, M642I) un L (T857A) segmentos, uzsver nepieciešamību veikt turpmāku izmeklēšanu, īpašu uzmanību pievēršot vertikālajai transmisijai un grūtniecības iznākumam.

Brazīlijas Veselības ministrija nesen ziņoja par pirmo augļa nāvi, ko izraisījis Orovs ar transmisiju no mātes bērnam Pernambuko. Tomēr asimptomātiski vai viegli gadījumi var būt nepietiekami pārstāvēti genoma datu kopās, tādējādi novirzot uzraudzības centienus. Tas uzsver nepieciešamību identificēt vīrusu faktorus, kas saistīti ar smagiem rezultātiem, un izstrādāt efektīvus pasākumus.

Pētījumā tika identificēti ar ORROV saistīti gadījumi, kas saistīti ar ceļošanu, kas liecina, ka cilvēka mobilitātei ir svarīga loma vīrusa izplatībā visā Brazīlijā. Galvenie ierobežojumi ir genoma datu trūkums no Kolumbijas, Kubas un citām skartajām valstīm, kas neļauj pilnībā izprast pārvades tīklus.

Kopumā pētījums uzsver nepieciešamību pēc nepārtrauktas genoma uzraudzības, lai izprastu OOV evolūcijas un epidemioloģisko dinamiku. Tas ir īpaši svarīgi, lai novērstu turpmākus uzliesmojumus un nodrošinātu savlaicīgu sabiedrības veselības reakciju.

Avoti: