Jak 196 000 hiszpańskich uczestników pomaga rozszyfrować ryzyko chorób serca

Jak 196 000 hiszpańskich uczestników pomaga rozszyfrować ryzyko chorób serca

Naukowcy gromadzą 35 kohort populacji Hiszpanii, aby dowiedzieć się, dlaczego niektórzy ludzie są bardziej podatni na choroby serca i jak medycyna precyzyjna może zmienić szanse.

W niedawnym badaniu opublikowanym w European Journal of Epidemiology naukowcy podsumowująCWspółpraca cOHortyRMONTAŻDATA na studia m.inmimechanizmy iLonmmIchoroba przewlekłaABadanie SES (Cordelia), proponowany wkład w naukę o układzie sercowo-naczyniowym i jego metodologię. W badaniu zebrano dane z 35 niezależnych kohort populacji hiszpańskiej (n = 196 632, średni wiek = 52 lata, 54% kobiet), aby odkryć zmienne, które przyczyniają się do chorób układu krążenia w tej grupie etnicznej.

Celem badania jest przeprowadzenie największego w Europie Południowej badania asocjacyjnego całego genomu (GWAS) skupiającego się na chorobach układu krążenia (CVD), którego celem będzie lepsze przewidywanie i zrozumienie chorób sercowo-naczyniowych, a nie bezpośrednie łagodzenie ich w regionie. Cordelia stanowi znaczący krok naprzód w zrozumieniu przez medycynę czynników ryzyka chorób układu krążenia i ma potencjał, aby przewodzić postępowi medycyny precyzyjnej w Europie Południowej.

tło

Miażdżycowe choroby układu krążenia (ASCVD) to przewlekłe choroby związane z wiekiem, spowodowane przez cholesterol, tłuszcze i inne nierozpuszczalne substancje pokrywające wyściółkę ścian tętnic, ostatecznie prowadzące do zmniejszenia lub nawet zatrzymania przepływu krwi. Chociaż cuda współczesnej nauki pomogły ograniczyć zachorowalność i śmiertelność na całym świecie, wydłużyły także długość życia ludzi, nieumyślnie przyczyniając się do starzenia się świata i wynikającego z tego wzrostu bezwzględnej liczby przypadków ASCVD.

Przez dziesięciolecia badań próbowano rozwikłać czynniki ryzyka, które przyczyniają się do genezy ASCVD, i jak dotąd zaobserwowano, że wszystkie czynniki genetyczne, środowiskowe i społeczno-ekonomiczne przyczyniają się do choroby i muszą być ściśle monitorowane. Chociaż zdrowy tryb życia może zmniejszać ryzyko ASCVD, czynniki ryzyka wykazują ciekawą, lokalnie rozbieżną cechę, w przypadku której zmienne, które silnie przewidują częstość występowania ASCVD w jednym regionie, niekoniecznie muszą odgrywać ważną rolę w częstości występowania ASCVD w innym miejscu.

„...uzasadnia tworzenie dużych kohort populacyjnych w niektórych regionach świata. Bardzo niewiele dużych kohort jest dostępnych w populacjach Europy Południowej i Morza Śródziemnego. W Hiszpanii niedawno rozpoczęta inicjatywa Impact Precision Medicine jest jedynym tego rodzaju badaniem kohortowym, w ramach którego do 2028 r. zrekrutowanych zostanie około 200 000 uczestników, a do 2038 r. zakończy się 10-letni okres obserwacji”.

Europa Południowa to populacja wysoce zrozumiała przez pryzmat ryzyka ASCVD (niewiele badań obejmuje próbki z regionu) i GWAS (nieliczna reprezentacja w bazach danych GWAS). Biorąc pod uwagę niedoskonałości obecnych modeli predykcyjnych w przewidywaniu ryzyka ASCVD w populacjach Europy Południowej, istotne jest utworzenie w regionie kohorty ASCVD skupionej na GWAS.

O Cordelii

Badanie Cordelia ma wyjść naprzeciw tej potrzebie poprzez wszechstronną ocenę czynników ryzyka ASCVD (środowiskowych, klinicznych, społeczno-ekonomicznych, genetycznych itp.) w populacjach Europy Południowej poprzez połączenie danych z 35 istniejących wcześniej kohort hiszpańskich. Celem jest także przeprowadzenie największych w regionie GWA skupionych na ASCVD i wykorzystanie tych danych do wygenerowania wielogenowych ocen ryzyka dla populacji z grupy ryzyka w celu przewidzenia prawdopodobieństwa zapadnięcia na ASCVD w ciągu 10 lat.

„Cordelia ma także na celu identyfikację podgrup populacji na podstawie ich genetycznych predyspozycji do chorób, w przypadku których dostępne leczenie farmakologiczne i modyfikacje stylu życia przyniosłyby największe korzyści. Wszystkie wcześniejsze ustalenia są podzielone według płci, co może zwiększyć znaczenie różnic płciowych w ASCVD, co może prowadzić do dokładniejszych i skuteczniejszych strategii zapobiegania”.

metodologia

35 hiszpańskich kohort ze zbioru danych Cordelia obejmuje łącznie 196 632 uczestników w wieku od 18 do 84 lat. Próbki DNA reprezentowały 60% uczestników, próbki surowicy/osocza stanowiły 50%, a dane dotyczące genotypów były już dostępne dla pięciu kohort, z których każda była genotypowana przy użyciu różnych platform i genomów referencyjnych. W przypadku pozostałych kohort standaryzacja genotypowania zostanie przeprowadzona przy użyciu Axiom™ Spain Biobank Array-2, aby ułatwić harmonizację danych.

Wszyscy uczestnicy otrzymali kwestionariusze (standaryzowane ankiety Światowej Organizacji Zdrowia [WHO]), które zawierały spersonalizowany kod, datę badania, wiek, płeć, region zamieszkania i stan cywilny. Zmienne te zsyntetyzowano w celu uwzględnienia zmiennych administracyjnych/demografii badania Cordelia.

Wyniki kliniczne oceniano za pomocą obserwacji opartej na zdarzeniach w okresach od 5 do 30 lat, w zależności od kohorty, przy czym każdy nagły przypadek medyczny (lub zdarzenie CVD) został zgłoszony przy użyciu Międzynarodowej Klasyfikacji Chorób (ICD-10 i ICD-9). Zbiory danych zostaną dodatkowo powiązane z danymi z oficjalnego rejestru umieralności hiszpańskiego Narodowego Instytutu Statystycznego i hiszpańskiego szpitala, a zbiory danych zostaną wypisane, co ułatwi przyszłe porównania zdarzeń śmiertelnych i niezakończonych śmiercią.

Ponadto wszyscy uczestnicy przeszli ocenę kliniczną, a dane uzupełniające zbierano w miarę upływu czasu głównie do celów badawczych, a nie powtarzanego pełnego pomiaru czynników ryzyka u wszystkich uczestników. Oceny te obejmowały badania krwi (po całonocnym poszczeniu) i kwestionariusze rejestrujące ostatnie zachowania zdrowotne (sen, ćwiczenia, palenie itp.).

Należy zauważyć, że chociaż istnieje wiele punktów danych, takich jak:

Ponadto zespół Cordelii opracował zharmonizowane algorytmy dla schorzeń takich jak nadciśnienie i cukrzyca, aby zapewnić spójność między kohortami, ponieważ definicje i podejścia do pomiaru czasami różniły się w ciągu 30-letniego okresu rekrutacji do badania.

Wstępne ustalenia

Jak dotąd badanie wykazało, że uczestnicy mają 52 lata (średnia), 54% to kobiety, a 96% urodziło się w Hiszpanii. Kohorta jest stosunkowo dobrze wykształcona – 20% posiada wykształcenie wyższe. Co pocieszające, 52% uczestników nigdy nie paliło, ale 24% stwierdziło, że pali regularnie.

Należy podkreślić, że niniejsza praca jest pierwszą wspólną publikacją Cordelia Meta-Cohort. W poprzednich publikacjach naukowych korzystano z danych pochodzących z poszczególnych kohort zintegrowanych obecnie z systemem Cordelia, a nie z samego nowego, zharmonizowanego zbioru metadanych. W publikacjach tych często wykorzystywano dane z poszczególnych kohort obecnie zintegrowanych z Cordelią, co odzwierciedlało szeroką użyteczność i wpływ naukowy zasobu.

Wnioski

Badanie Cordelii wydaje się obiecujące jako kolejny krok w walce Europy Południowej z ASCVD. Po ukończeniu badanie będzie obejmowało największą kohortę ASCVD w regionie oraz najbardziej wszechstronne i szczegółowe GWA na świecie dla osób pochodzenia południowoeuropejskiego. Szczegółowe metody gromadzenia danych zastosowane w projekcie ułatwiają badania w obszarach niezwiązanych z ASCVD, takich jak Covid-19, nowotwory i sen.

„Łącząc kompleksowe dane kliniczne, środowiskowe, genetyczne i społeczno-ekonomiczne, Cordelia pokazuje, jak wspólne badania na dużą skalę mogą przyczynić się do rozwoju medycyny precyzyjnej”.

Naukowcy ostrzegają jednak, że badanie Cordelii ma kilka ograniczeń. Dane pochodziły z kohort, które stosowały różne metody rekrutacji, okresy i zmienne definicje, co skutkowało niejednorodnością zbioru danych. Nie wszystkie zmienne zebrano w ten sam sposób – niektóre dane zostały zgłoszone samodzielnie, a strategie rekrutacji różnią się (w tym kohorty populacyjne, szpitalne i pracownicze).

Próbki DNA i próbki biologiczne reprezentowały tylko podzbiór uczestników (odpowiednio 60% i 50%). Zdolność do wykrywania powiązań z rzadkimi wariantami genetycznymi jest ograniczona, a kohorta może nie być w pełni reprezentatywna dla szerszych populacji Hiszpanii lub Europy Południowej.

Zespół Cordelii wdrożył podejścia statystyczne i metodologiczne, aby rozwiązać te problemy (np. modele harmonizacji i efektów mieszanych), jednak wyzwania te należy wziąć pod uwagę przy interpretacji wyników badania.

Źródła: